Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Znf608Q56A10 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf608Q56A10 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf608Q56A10 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms