Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spire1Q52KF3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms