Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Khdc1cQ4KL78 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Khdc1cQ4KL78 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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