Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms