Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Afg1lQ3V384 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg1lQ3V384 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms