Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnah12Q3V0Q1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms