Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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Lrrc43Q3V0L5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Lrrc43Q3V0L5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Lrrc43Q3V0L5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Lrrc43Q3V0L5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Lrrc43Q3V0L5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc43Q3V0L5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms