Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc27Q3V036 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms