Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prdm6Q3UZD5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms