Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5aQ3UXZ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms