Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Znf48Q3US17 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Znf48Q3US17 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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