Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms