Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog7Q3UM29 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms