Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms