Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms