Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms