Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms