Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cops9Q3U898 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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