Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Rnf180Q3U827 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Rnf180Q3U827 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Rnf180Q3U827 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rnf180Q3U827 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf180Q3U827 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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