Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U1D9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U1D9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U1D9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U1D9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U1D9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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