Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TraddQ3U0V2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TraddQ3U0V2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms