Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc9Q3U0M1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms