Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms