Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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