Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdnep1Q3TP92 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms