Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca4Q3TKT4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca4Q3TKT4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms