Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp3Q3TIX6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms