Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde12Q3TIU4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde12Q3TIU4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde12Q3TIU4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde12Q3TIU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms