Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap5b1Q3TAP4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap5b1Q3TAP4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms