Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Colec11Q3SXB8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Colec11Q3SXB8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms