Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms