Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc162pQ0VG85 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms