Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc39dQ0VF76 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms