Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne7Q0VE82 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms