Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Itgb8Q0VBD0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Itgb8Q0VBD0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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