Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spata18Q0P557 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata18Q0P557 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms