Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrioQ0KL02 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms