Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pate4Q09098 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms