Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnma1Q08460 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms