Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms