Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms