Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Caprin2Q05A80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Caprin2Q05A80 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms