Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mex3cQ05A36 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mex3cQ05A36 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms