Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms