Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms