Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms