Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcad1Q04692 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms