Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms