Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CkbQ04447 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CkbQ04447 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms