Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn6Q03958 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms